通常，冷冻干燥或冻干循环分为三个阶段：
  
  初始冷冻过程，以下述方式进行：产物显示出所需的晶体结构，产品在低于其共晶温度下冷冻。
  
  初级干燥（升华）阶段，在此阶段：产品周围蒸汽的分压必须低于冰的蒸汽压力，在相同温度下，以热量形式供应的能量必须保持低于产品的共晶温度（升华条件下允许的^高产品温度）。
  
  二次干燥旨在消除由于吸收而残留的^终痕量水，其中：从产品中升起的蒸汽分压将处于^低水平。在该过程完成后，处理过的产品将具有保留其形状，体积和原始结构-以及其所有物理，化学和生物特性。然后可以将其储存（假设包装对减少水分迁移有效）几乎无限期。由于产品是多孔的，可以通过简单添加适当的溶剂来重新溶解。